A polimerase de DNA é uma enzima essencial para a replicação do material genético em células vivas. Existem diversos tipos de polimerases de DNA, cada uma com funções específicas e estruturas distintas. Essas enzimas são responsáveis por sintetizar novas cadeias de DNA durante a replicação, reparo e recombinação do material genético. Neste texto, abordaremos os principais tipos de polimerases de DNA, suas funções e estruturas.
Conheça os diferentes tipos de DNA polimerase e suas funções biológicas específicas.
A polimerase de DNA é uma enzima essencial no processo de replicação do DNA. Existem diferentes tipos de DNA polimerase, cada um com funções biológicas específicas. A polimerase de DNA I, por exemplo, é responsável pela síntese de DNA durante a replicação do genoma bacteriano. Já a polimerase de DNA II está envolvida na reparação do DNA danificado.
Além disso, existem outras polimerases de DNA, como a polimerase de DNA III, que é a principal enzima responsável pela replicação do DNA em bactérias. A polimerase de DNA IV atua na reparação de DNA danificado por agentes mutagênicos, enquanto a polimerase de DNA V está envolvida na tolerância ao dano do DNA.
Cada tipo de polimerase de DNA possui uma estrutura única, que determina suas funções biológicas específicas. Por exemplo, a polimerase de DNA I possui um domínio 3’→5′ exonuclease, que permite corrigir erros durante a síntese do DNA.
Em resumo, conhecer os diferentes tipos de DNA polimerase e suas funções biológicas específicas é fundamental para entender o processo de replicação e reparação do DNA. Cada polimerase desempenha um papel importante na manutenção da integridade do genoma.
Qual a função da polimerase e como ela atua no processo de replicação do DNA?
A polimerase de DNA é uma enzima essencial no processo de replicação do DNA. Sua principal função é sintetizar novas cadeias de DNA a partir de um molde de DNA existente. Existem vários tipos de polimerase de DNA, cada um com sua própria função e localização dentro da célula.
Na replicação do DNA, a polimerase atua adicionando nucleotídeos à cadeia de DNA em crescimento. Ela funciona de forma altamente precisa, garantindo que os nucleotídeos corretos sejam emparelhados com os nucleotídeos no molde de DNA. Isso garante a fidelidade na replicação do DNA, essencial para a transmissão precisa das informações genéticas de uma célula para suas células filhas.
Além disso, a polimerase de DNA também possui a capacidade de corrigir erros durante a replicação, por meio de um mecanismo chamado de “correção de prova”. Essa função adiciona uma camada extra de precisão ao processo de replicação, garantindo a integridade do material genético.
Em resumo, a polimerase de DNA desempenha um papel fundamental na replicação do DNA, sendo responsável por sintetizar novas cadeias de DNA e garantir a fidelidade e integridade do material genético. Sua atuação precisa e eficiente é essencial para a manutenção da estabilidade genômica e a transmissão correta das informações genéticas.
DNA polimerase 3: qual sua função e importância na replicação do DNA?
A DNA polimerase 3 é uma enzima crucial no processo de replicação do DNA. Sua função principal é sintetizar a cadeia de DNA complementar durante a replicação, garantindo a precisão e a fidelidade da cópia do material genético. A importância dessa enzima reside no fato de que ela é altamente eficiente e precisa, atuando de forma rápida e eficaz na replicação do DNA.
A DNA polimerase 3 é uma das principais polimerases envolvidas na replicação do DNA em organismos procariontes, como bactérias. Ela é responsável por adicionar nucleotídeos à nova cadeia de DNA, seguindo o modelo da cadeia molde. Sua estrutura complexa permite que ela se ligue ao DNA e deslize ao longo da molécula, adicionando os nucleotídeos de forma coordenada e precisa.
Em resumo, a DNA polimerase 3 desempenha um papel fundamental na replicação do DNA, garantindo a transmissão correta da informação genética de uma célula para suas células filhas. Sua eficiência e precisão são essenciais para a manutenção da integridade do genoma e a sobrevivência dos organismos.
Qual é a importância da DNA polimerase 2 na replicação do material genético?
A DNA polimerase 2 é uma enzima essencial no processo de replicação do material genético. Ela desempenha um papel fundamental na síntese de novas cadeias de DNA, garantindo a fidelidade e a integridade do genoma.
Uma das principais funções da DNA polimerase 2 é corrigir erros que ocorrem durante a replicação do DNA, garantindo a precisão na transmissão das informações genéticas de uma geração para outra. Além disso, ela também é responsável por preencher as lacunas deixadas pelo complexo de replicação, contribuindo para a formação de novas moléculas de DNA.
Outro aspecto importante da DNA polimerase 2 é a sua capacidade de atuar em condições de alta temperatura, tornando-a essencial em processos como a reação em cadeia da polimerase (PCR). Sua estrutura única permite que ela funcione de maneira eficiente mesmo em ambientes extremos, ampliando as possibilidades de aplicação da técnica de amplificação de DNA.
Em resumo, a DNA polimerase 2 desempenha um papel crucial na replicação do material genético, garantindo a estabilidade e a precisão do genoma. Sua capacidade de corrigir erros e de atuar em condições adversas a torna uma peça fundamental nos processos biológicos que envolvem a replicação do DNA.
Polimerase de DNA: tipos, função e estrutura
A polimerase de ADN é uma enzima que é responsável por catalisar a polimerização de nova cadeia de ADN durante a replicação desta molécula. Sua principal função é combinar o trifosfato desoxirribonucleotídico com os da cadeia modelo. Também participa do reparo do DNA.
Essa enzima permite o emparelhamento correto entre as bases de DNA da cadeia modelo e a nova, seguindo o esquema de pares A com T e G com C.
Fonte: Yikrazuul [CC BY-SA 3.0 (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0)], do Wikimedia Commons
O processo de replicação do DNA deve ser eficaz e deve ser realizado rapidamente, para que a polimerase do DNA atue adicionando cerca de 700 nucleotídeos por segundo e cometa apenas um erro a cada 10 9 ou 10 10 nucleotídeos incorporados.
Existem diferentes tipos de DNA polimerase. Eles variam tanto em eucariotos quanto em procariontes , e cada um tem um papel específico na replicação e reparo do DNA.
É possível que uma das primeiras enzimas a aparecer na evolução tenha sido a polimerase, uma vez que a capacidade de replicar com precisão o genoma é um requisito intrínseco ao desenvolvimento de organismos.
A descoberta desta enzima é atribuída a Arthur Kornberg e seus colegas. Este pesquisador identificou a DNA polimerase I (Pol I) em 1956, enquanto trabalhava com Escherichia coli. Da mesma forma, foi Watson e Crick quem propôs que essa enzima pudesse produzir cópias fiéis da molécula de DNA.
Tipos
Procariontes
Organismos procarióticos (organismos sem um núcleo verdadeiro, delimitado por uma membrana) têm três principais polimerases de DNA, comumente abreviadas como pol I, II e III.
A DNA polimerase I participa da replicação e reparo do DNA e possui atividade de exonuclease em ambas as direções. O papel desta enzima na replicação é considerado secundário.
II participa do reparo do DNA e sua atividade de exonuclease é no sentido 3 ‘-5’. III participa da replicação e revisão do DNA e, como a enzima anterior, exibe atividade de exonucleases no sentido 3 ‘-5’.
Eucariotos
Os eucariotos (organismos com um núcleo verdadeiro, delimitado por uma membrana) têm cinco polimerases de DNA, chamadas com letras do alfabeto grego: α, β, γ, δ e ε.
Γ A polimerase está localizada nas mitocôndrias e é responsável pela replicação do material genético nessa organela celular. Por outro lado, os outros quatro estão no núcleo das células e estão envolvidos na replicação do DNA nuclear.
As variantes α, δ e ε são as mais ativas no processo de divisão celular, sugerindo que sua principal função está associada à produção de cópias de DNA.
A DNA polimerase β, enquanto isso, tem picos de atividade nas células que não estão se dividindo, portanto, assume-se que sua principal função esteja associada ao reparo do DNA.
Diferentes experiências foram capazes de verificar a hipótese que associa principalmente as polimerases α, δ e ε com a replicação do DNA. Os tipos γ, δ e ε possuem atividade de exonuclease 3 ‘-5’.
Arcos
Os novos métodos de sequenciamento conseguiram identificar uma enorme variedade de famílias de DNA polimerase. Na arquéia, especificamente, foi identificada uma família de enzimas, denominada família D, únicas para esse grupo de organismos.
Funções: replicação e reparo de DNA
O que é replicação de DNA?
O DNA é a molécula que carrega toda a informação genética de um organismo. É formado por um açúcar, uma base de nitrogênio (adenina, guanina, citosina e timina) e um grupo fosfato.
Durante os processos de divisão celular, que ocorrem constantemente, o DNA deve ser copiado com rapidez e precisão – especificamente na fase S do ciclo celular. Esse processo em que a célula copia o DNA é conhecido como replicação.
Estruturalmente, a molécula de DNA é formada por duas cadeias, formando uma hélice. Durante o processo de replicação, eles se separam e cada um age como um temperamento para a formação de uma nova molécula. Assim, os novos filamentos passam para as células filhas no processo de divisão celular.
Como cada fita serve como um temperamento, diz-se que a replicação do DNA é semi-conservadora – no final do processo, a nova molécula consiste em uma nova e uma antiga. Esse processo foi descrito em 1958 pelos pesquisadores Meselson e Stahl, usando isótopos.
A replicação do DNA requer uma série de enzimas que catalisam o processo. Dentre essas moléculas de proteína, destaca-se a DNA polimerase.
Reacção
Para a síntese de DNA, são necessários os substratos necessários para o processo: trifosfato de desoxirribonucleotídeo (dNTP)
O mecanismo da reação envolve um ataque nucleofílico do grupo hidroxila na extremidade 3 ‘da fita em crescimento no fosfato alfa dos dNTPs complementares, eliminando um pirofosfato. Este passo é muito importante, uma vez que a energia para polimerização provém da hidrólise dos dNTPs e do pirofosfato resultante.
Pol III ou alfa se liga ao primeiro (ver propriedades da polimerase) e começa a adicionar nucleotídeos. O epsilon alonga a cadeia principal e o delta alonga o fio atrasado.
Propriedades das polimerases de DNA
Todas as polimerases de DNA conhecidas compartilham duas propriedades essenciais associadas ao processo de replicação.
Primeiro, todas as polimerases sintetizam a fita de DNA na direção 5′-3 ‘, adicionando os dNTPs ao grupo hidroxila da cadeia crescente.
Segundo, as polimerases de DNA não podem começar a sintetizar uma nova cadeia do nada. Eles precisam de um elemento adicional conhecido como primeiro ou iniciador, que é uma molécula formada por alguns nucleotídeos que concede um grupo hidroxila livre, onde a polimerase pode ancorar e iniciar sua atividade.
Essa é uma das diferenças fundamentais entre as polimerases de DNA e RNA, uma vez que esta é capaz de iniciar a síntese de uma cadeia de novo.
Fragmentos de Okazaki
A primeira propriedade das polimerases de DNA mencionadas na seção anterior é uma complicação para a replicação semi-conservadora. Como as duas cadeias de DNA são antiparalelas, uma delas é sintetizada descontinuamente (que precisaria ser sintetizada no sentido 3′-5 ‘).
Na cadeia retardada, a síntese descontínua ocorre através da atividade normal da polimerase, 5′-3 ‘, e os fragmentos resultantes – conhecidos na literatura como fragmentos de Okazaki – são unidos por outra enzima, a ligase.
Reparo de DNA
O DNA é constantemente exposto a fatores endógenos e exógenos que podem danificá-lo. Esses danos podem bloquear a replicação e se acumular, afetando a expressão dos genes, gerando problemas nos diferentes processos celulares.
Além de seu papel no processo de replicação do DNA, a polimerase também é um componente essencial dos mecanismos de reparo do DNA. Eles também podem atuar como sensores no ciclo celular que impedem a entrada na fase de divisão se o DNA for danificado.
Estrutura
Atualmente, graças aos estudos de cristalografia, foi possível elucidar as estruturas de várias polimerases. Com base em sua sequência primária, as polimerases são agrupadas em famílias: A, B, C, X e Y.
Alguns aspectos são comuns a todas as polimerases, particularmente aquelas relacionadas aos centros catalíticos da enzima.
Isso inclui dois locais ativos chave que possuem íons metálicos, com dois resíduos de aspartato e um resíduo variável – aspartato ou glutamato, que coordena os metais. Há outra série de resíduos carregados que circundam o centro catalítico e são conservados nas diferentes polimerases.
Nos procariontes, a DNA polimerase I é um polipeptídeo de 103 kd, II é um polipeptídeo de 88 kd e III consiste em dez subunidades.
Nos eucariotos, as enzimas são maiores e mais complexas: α é formado por cinco unidades, β e γ por uma subunidade, δ por duas subunidades e ε por 5.
Aplicações
RPC
A reação em cadeia da polimerase (RPC) é um método usado em todos os laboratórios de biologia molecular, graças à sua utilidade e simplicidade. O objetivo deste método é amplificar massivamente uma molécula de DNA de interesse.
Para conseguir isso, os biólogos usam uma polimerase de DNA que não é danificada pelo calor (altas temperaturas são indispensáveis para esse processo) para amplificar a molécula. O resultado desse processo é um grande número de moléculas de DNA que podem ser usadas para diferentes fins.
Uma das utilidades clínicas mais importantes da técnica é seu uso no diagnóstico médico. A RPC pode ser usada para verificar a presença de bactérias e vírus patogênicos nos pacientes.
Antibióticos e medicamentos antitumorais
Um número significativo de medicamentos visa truncar os mecanismos de replicação do DNA no organismo patogênico, seja um vírus ou uma bactéria.
Em parte disso, o alvo é a inibição da atividade da DNA polimerase. Por exemplo, a droga quimioterapêutica citarabina, também chamada citosina arabinosídeo, desativa a DNA polimerase.
Referências
- Alberts, B., Bray, D., Hopkin, K., Johnson, AD, Lewis, J., Raff, M., & Walter, P. (2015).Biologia celular essencial . Garland Science
- Cann, IK, & Ishino, Y. (1999). Replicação do DNA arqueano: identificando as peças para resolver um quebra-cabeça.Genetics , 152 (4), 1249-67.
- Cooper, GM e Hausman, RE (2004).A célula: abordagem molecular . Medicinska naklada.
- Garcia-Diaz, M., & Bebenek, K. (2007). Múltiplas funções das polimerases de DNA.Revisões críticas em ciências das plantas , 26 (2), 105-122.
- Shcherbakova, PV, Bebenek, K. e Kunkel, TA (2003). Funções das polimerases de DNA eucariótico.Science SAGE KE , 2003 (8), p. 3.
- Steitz, TA (1999). Polimerases de DNA: diversidade estrutural e mecanismos comuns.Journal of Biological Chemistry , 274 (25), 17395-17398.
- Wu, S., Barba, WA, Pedersen, LG, & Wilson, SH (2013). A comparação estrutural da arquitetura da DNA polimerase sugere um gateway nucleotídico para o sítio ativo da polimerase.Chemical reviews , 114 (5), 2759-74.