Ligação fosfodiéster: como é formada, função e exemplos

As ligações fosfodiéster são ligações químicas que ocorrem entre os átomos de fósforo de um nucleotídeo e os grupos hidroxila de outros nucleotídeos. Essas ligações são essenciais na formação de ácidos nucleicos, como o DNA e o RNA. A função principal das ligações fosfodiéster é unir os nucleotídeos em uma cadeia linear, formando assim a estrutura molecular dos ácidos nucleicos. Exemplos de ligações fosfodiéster podem ser observados na estrutura do DNA, onde os nucleotídeos são ligados por meio dessas ligações, formando a dupla hélice característica da molécula.

A importância da ligação fosfodiéster na estrutura e função dos ácidos nucleicos.

A ligação fosfodiéster é de extrema importância na estrutura e função dos ácidos nucleicos, como o DNA e o RNA. Essa ligação é responsável por unir os nucleotídeos, que são os blocos de construção dos ácidos nucleicos. Ela ocorre entre o grupo fosfato de um nucleotídeo e o grupo hidroxila de outro nucleotídeo, formando uma ligação covalente forte.

Na estrutura dos ácidos nucleicos, as ligações fosfodiéster formam a espinha dorsal da molécula, conferindo estabilidade e rigidez. Além disso, essas ligações permitem que os nucleotídeos sejam organizados de forma específica, determinando a sequência de bases nitrogenadas que carregam a informação genética.

Quanto à função dos ácidos nucleicos, a ligação fosfodiéster é essencial para a replicação do DNA e a transcrição do RNA. Durante a replicação, as enzimas responsáveis pela síntese do DNA utilizam as ligações fosfodiéster para adicionar novos nucleotídeos à cadeia existente. Já na transcrição, o RNA é sintetizado a partir do DNA, também com a ajuda das ligações fosfodiéster.

Em resumo, a ligação fosfodiéster é fundamental para a estruturação e funcionamento dos ácidos nucleicos, garantindo a estabilidade, organização e transmissão da informação genética. Sem essa ligação, a vida como a conhecemos não seria possível.

Qual a importância do grupo fosfato na composição dos nucleotídeos?

O grupo fosfato é de extrema importância na composição dos nucleotídeos, pois é responsável por ligar os nucleotídeos entre si, formando as cadeias de DNA e RNA. Essa ligação ocorre através da ligação fosfodiéster, que une o carbono 3′ de um nucleotídeo ao carbono 5′ do próximo, formando assim uma cadeia linear.

Além disso, o grupo fosfato também fornece carga negativa às moléculas de nucleotídeos, o que contribui para a estabilidade das cadeias de DNA e RNA. Essa carga negativa ajuda a repelir outras moléculas carregadas negativamente, mantendo as cadeias afastadas e evitando que se enrolem ou se emaranhem.

Portanto, sem o grupo fosfato, as moléculas de nucleotídeos não seriam capazes de se ligar entre si de forma estável, impedindo a formação das cadeias de DNA e RNA, essenciais para a transmissão e expressão dos genes em todos os organismos vivos.

Ligação fosfodiéster: como é formada, função e exemplos

Entendendo a importância dos nucleotídeos no funcionamento do DNA e RNA.

Os nucleotídeos desempenham um papel fundamental no funcionamento do DNA e RNA. Eles são os blocos de construção dessas moléculas, que são essenciais para a vida. Cada nucleotídeo é composto por três partes: um grupo fosfato, um açúcar (desoxirribose no DNA e ribose no RNA) e uma base nitrogenada.

A base nitrogenada é responsável por determinar a sequência de nucleotídeos na molécula de DNA ou RNA. Existem quatro bases nitrogenadas diferentes: adenina (A), citosina (C), guanina (G) e timina (T) no DNA, e uracila (U) no RNA. A sequência de bases nitrogenadas é o que codifica a informação genética e determina as características de um organismo.

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Os nucleotídeos se ligam entre si através de ligações fosfodiéster, que são ligações covalentes entre o grupo fosfato de um nucleotídeo e o açúcar do próximo nucleotídeo. Essas ligações formam a espinha dorsal da molécula de DNA ou RNA, fornecendo estabilidade e estrutura para a molécula.

A função das ligações fosfodiéster é manter a sequência de nucleotídeos na molécula de DNA ou RNA, garantindo a integridade da informação genética. Sem essas ligações, a molécula se desintegraria e a informação genética seria perdida.

Um exemplo de ligações fosfodiéster pode ser encontrado na molécula de DNA, onde os nucleotídeos se ligam em uma sequência específica para formar os genes. Esses genes contêm as instruções para a síntese de proteínas e são essenciais para o funcionamento e desenvolvimento dos organismos.

Exemplos de ácidos nucleicos: o que são e como funcionam em organismos vivos.

Os ácidos nucleicos são moléculas essenciais para a vida, responsáveis por armazenar e transmitir informações genéticas em organismos vivos. Existem dois tipos principais de ácidos nucleicos: o ácido desoxirribonucleico (DNA) e o ácido ribonucleico (RNA).

O DNA é encontrado no núcleo das células e contém a informação genética hereditária de um organismo. Ele é composto por cadeias de nucleotídeos que se ligam entre si por meio de ligações fosfodiéster. Já o RNA tem diversas funções, incluindo a síntese de proteínas e a regulação genética.

Ligação fosfodiéster: como é formada, função e exemplos.

A ligação fosfodiéster é uma ligação covalente que conecta os nucleotídeos em uma cadeia de ácido nucleico. Ela é formada pela ligação entre o grupo fosfato de um nucleotídeo e o grupo hidroxila de outro nucleotídeo, liberando uma molécula de água no processo.

A função da ligação fosfodiéster é manter os nucleotídeos unidos em uma cadeia, permitindo a formação de moléculas de DNA e RNA. Essa ligação é essencial para a estrutura e estabilidade dos ácidos nucleicos.

Um exemplo de ligação fosfodiéster pode ser encontrado na molécula de DNA, onde os nucleotídeos se ligam em uma sequência específica por meio dessa ligação. Essa estrutura em forma de dupla hélice permite que a informação genética seja armazenada e transmitida de geração em geração.

Ligação fosfodiéster: como é formada, função e exemplos

As ligações fosfodiéster são ligações covalentes que ocorrem entre dois dos átomos de oxigénio de um grupo fosfato e grupos hidroxilo de duas moléculas diferentes. Nesse tipo de ligação, o grupo fosfato atua como uma “ponte” de ligação estável entre as duas moléculas através de seus átomos de oxigênio.

O papel fundamental das ligações fosfodiéster na natureza é o da formação de cadeias de ácidos nucleicos, tanto de DNA quanto de RNA . Juntamente com os açúcares pentoses (desoxirribose ou ribose, conforme o caso), os grupos fosfato fazem parte da estrutura de suporte dessas importantes biomoléculas .

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Ligação de fosfodiéster no esqueleto do DNA (Fonte: Arquivo: Phosphodiester link.png, Arquivo: PhosphodiesterBondDiagram.png: Usuário: G3pro () Usuário: G3pro () Usuário: G3pro at en.wikipedia.org Trabalho derivado: Usuário: Merops () Trabalho derivado: Usuário : Deneapol () Trabalho derivado: Usuário: KES47 () Texto modificado: Incnis Mrsi () Texto modificado: DMacks ()) Trabalho derivado: Usuário: Miguelferig () com ionização [CC BY-SA 3.0 (http: //creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/)], via Wikimedia Commons)
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As cadeias nucleotídicas de DNA ou RNA, como proteínas, podem assumir diferentes conformações tridimensionais que são estabilizadas por ligações não covalentes, como ligações de hidrogênio entre bases complementares.

No entanto, a estrutura primária é dada pela sequência linear de nucleotídeos ligados covalentemente por meio de ligações fosfodiéster.

Como é formada uma ligação fosfodiéster?

Assim como as ligações peptídicas nas proteínas e as ligações glicosídicas entre os monossacarídeos , as ligações fosfodiéster resultam de reações de desidratação nas quais uma molécula de água é perdida. A seguir, o esquema geral de uma dessas reações de desidratação:

HX 1 -OH + HX 2 -OH → HX 1 -X 2 -OH + H 2 S

Os íons fosfato correspondem à base conjugada completamente desprotonada do ácido fosfórico e são chamados fosfatos inorgânicos, cuja abreviação é denotada como Pi. Quando dois grupos fosfato são ligados, uma ligação fosfato anidra é formada e uma molécula conhecida como pirofosfato inorgânico ou PPi é obtida.

Quando um íon fosfato se liga a um átomo de carbono de uma molécula orgânica, a ligação química é chamada de éster fosfato e a espécie resultante é um monofosfato orgânico. Se a molécula orgânica se ligar a mais de um grupo fosfato, formam-se difosfatos orgânicos ou trifosfatos orgânicos.

Quando uma única molécula de fosfato inorgânico se liga a dois grupos orgânicos, é utilizada uma ligação fosfodiéster ou “fosfato diéster”. É importante não confundir as ligações fosfodiéster com as ligações fosfoanidro de alta energia entre os grupos fosfato de moléculas como ATP , por exemplo.

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Diferenças entre fosfatos e fosforilos (Fonte: Strater [GFDL (http://www.gnu.org/copyleft/fdl.html)) ou CC BY-SA 3.0 (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/ 3.0)], via Wikimedia Commons)

As ligações fosfodiéster entre nucleotídeos adjacentes consistem em duas ligações fosfoéster que ocorrem entre o hidroxil na posição 5 ‘de um nucleotídeo e o hidroxil na posição 3’ do próximo nucleotídeo em uma fita de DNA ou RNA.

Dependendo das condições do meio, essas ligações podem ser hidrolisadas enzimaticamente e não enzimaticamente.

Enzimas envolvidas

A formação e quebra de ligações químicas é crucial para todos os processos vitais como os conhecemos, e o caso das ligações fosfodiéster não é exceção.

Entre as enzimas mais importantes que podem formar essas ligações estão as polimerases de DNA ou RNA e ribozimas . As enzimas fosfodiesterase são capazes de hidrolisar enzimaticamente.

Durante a replicação, um processo crucial para a proliferação celular, em cada ciclo da reação, um dNTP (desoxinucleotídeo trifosfato) complementar à base do molde é incorporado ao DNA por uma reação de transferência de nucleotídeos.

A polimerase é responsável por formar um novo elo entre o 3′-OH da fita modelo e o α-fosfato do dNTP, graças à energia liberada pela ruptura das ligações entre os fosfatos α e β do dNTP, que estão ligados por ligações fosfoanidro.

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O resultado é a extensão da cadeia por um nucleotídeo e a liberação de uma molécula de pirofosfato (PPi) s. Foi determinado que essas reações merecem dois íons divalentes de magnésio (Mg 2+ ), cuja presença permite a estabilização eletrostática do nucleófilo OH para alcançar a abordagem do local ativo da enzima.

O pKa de um de uma ligação fosfodiéster está próximo de 0, de modo que, em solução aquosa estas ligações são totalmente ionizado, carregado negativamente.

Isso dá às moléculas de ácido nucleico uma carga negativa, que é neutralizada graças às interações iônicas com as cargas positivas dos resíduos de aminoácidos das proteínas, ligação eletrostática com íons metálicos ou associação com poliaminas.

Em uma solução aquosa, as ligações fosfodiéster nas moléculas de DNA são muito mais estáveis ​​que nas moléculas de RNA. Numa solução alcalina, as referidas ligações nas moléculas de RNA são clivadas por deslocamento intramolecular do nucleosídeo na extremidade 5 ‘por um oxianião 2’.

Função e exemplos

Como mencionado, o papel mais importante desses vínculos é a participação deles na formação do esqueleto das moléculas de ácido nucleico, que são as moléculas mais importantes do mundo celular.

A atividade das enzimas topoisomerase, que participam ativamente da replicação do DNA e da síntese proteica , depende da interação das ligações fosfodiéster na extremidade 5 ‘do DNA com a cadeia lateral dos resíduos de tirosina no local ativo destes. enzimas

Moléculas que participam como segundos mensageiros, como adenosina monofosfato cíclico (cAMP) ou trifosfato de guanosina cíclica (cGTP), possuem ligações fosfodiéster que são hidrolisadas por enzimas específicas conhecidas como fosfodiesterases, cuja participação é de suma importância para muitos processos de sinalização telefone celular

Os glicerofosfolípides, componentes fundamentais nas membranas biológicas, são compostos de uma molécula de glicerol que liga as ligações fosfodiéster aos grupos polares de “cabeça” que compõem a região hidrofílica da molécula.

Referências

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