Dedos de zinco: estrutura, classificação, função e importância

Os dedos de zinco são estruturas presentes em algumas espécies de animais marinhos, como moluscos, equinodermos e crustáceos, que desempenham um papel fundamental em suas atividades cotidianas. Esses apêndices são compostos principalmente por zinco, um metal essencial para a saúde e sobrevivência desses organismos. Os dedos de zinco podem ser classificados de acordo com sua forma, tamanho e função específica, sendo responsáveis por diversas funções vitais, como defesa, alimentação, locomoção e reprodução. Sua importância no ecossistema marinho é significativa, contribuindo para a manutenção do equilíbrio e da biodiversidade dos oceanos. Neste contexto, o estudo e compreensão dos dedos de zinco são fundamentais para a preservação dessas espécies e de seus habitats naturais.

O receptor possui um domínio de ligação ao DNA conhecido como dedos de zinco.

Os dedos de zinco são estruturas proteicas encontradas em diversos tipos de proteínas, incluindo fatores de transcrição. Esses dedos de zinco são responsáveis por se ligarem ao DNA, regulando assim a expressão gênica. O receptor possui um domínio de ligação ao DNA conhecido como dedos de zinco, que desempenham um papel crucial na regulação da transcrição de genes.

Existem diferentes tipos de dedos de zinco, que podem ser classificados de acordo com a sua estrutura. Alguns dedos de zinco possuem apenas uma hélice alfa e um loop, enquanto outros possuem duas hélices alfa e um loop. Essas variações na estrutura dos dedos de zinco podem influenciar a sua função e especificidade de ligação ao DNA.

Os dedos de zinco desempenham uma função importante na regulação da expressão gênica, atuando como mediadores entre os fatores de transcrição e o DNA. Eles são essenciais para a ligação específica do fator de transcrição ao seu sítio de ligação no DNA, permitindo assim a ativação ou repressão da transcrição de genes específicos.

Em resumo, os dedos de zinco são estruturas proteicas com a capacidade de se ligarem ao DNA e regular a expressão gênica. Eles desempenham um papel fundamental na regulação da transcrição de genes e são essenciais para a manutenção da homeostase celular.

Entenda o que é o minério de zinco e sua importância na indústria moderna.

O zinco é um elemento químico de número atômico 30 e símbolo Zn. Ele é amplamente utilizado na indústria moderna devido às suas propriedades únicas. Uma das principais fontes de zinco é o minério de zinco, que é extraído da crosta terrestre.

O minério de zinco é uma rocha que contém concentrações de zinco suficientes para ser economicamente viável extrair o metal. Ele é geralmente encontrado em associação com outros minerais, como a esfalerita e a smithsonita. A extração e processamento do minério de zinco são essenciais para a produção de diversos produtos, como baterias, revestimentos de aço, fertilizantes e medicamentos.

O zinco é um metal essencial para a vida, desempenhando um papel crucial em várias funções biológicas. Ele está presente em diversas enzimas e proteínas do corpo humano, participando de processos como a síntese de DNA, a cicatrização de feridas e o sistema imunológico.

Relacionado:  Por que o tucano está em perigo de extinção?

No entanto, o excesso de zinco no organismo pode ser prejudicial à saúde, causando sintomas como náuseas, vômitos e dores de cabeça. Por isso, é importante manter um equilíbrio adequado de zinco através da alimentação e, se necessário, suplementação.

Em resumo, o zinco é um elemento essencial para a vida e para a indústria moderna, sendo encontrado principalmente no minério de zinco. Sua importância se reflete na sua presença em uma variedade de produtos e processos, tornando-o um metal indispensável para a sociedade atual.

Dedos de zinco: estrutura, classificação, função e importância

O dedo de zinco (ZF) são motivos estruturais presentes em muitas proteínas eucarióticas. Eles pertencem ao grupo de metaloproteínas, pois são capazes de unir o íon zinco-metal, necessários para o seu funcionamento. Prevê-se que existam mais de 1500 domínios ZF em cerca de 1000 proteínas diferentes em humanos.

O termo dedo de zinco ou “dedo de zinco” foi cunhado em 1985 por Miller, McLachlan e Klug, enquanto estudava em detalhes os pequenos domínios de ligação ao DNA do fator transcricional TFIIIA de Xenopus laevis , descrito por outros autores alguns anos antes. .

Dedos de zinco: estrutura, classificação, função e importância 1

Representação gráfica do motivo do dedo do zinco em proteínas (Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com) [GFDL (http://www.gnu.org/copyleft/fdl.html) ou CC BY-SA 4.0 (https: // creativecommons .org / licenças / by-sa / 4.0)], via Wikimedia Commons)

Proteínas com motivos ZF estão entre as mais abundantes no genoma de organismos eucarióticos e participam de uma variedade de processos celulares essenciais, incluindo transcrição genética, tradução de proteínas, metabolismo, dobragem e montagem de outras proteínas e lipídios , morte celular programada, entre outros.

Estrutura

A estrutura dos motivos ZF é extremamente preservada. Normalmente, essas regiões repetidas têm de 30 a 60 aminoácidos, cuja estrutura secundária é encontrada como duas folhas beta-antiparalelas que formam um grampo de cabelo e uma hélice alfa, que é denotada como ββα.

Essa estrutura secundária é estabilizada por interações hidrofóbicas e pela coordenação de um átomo de zinco dado por dois resíduos de cisteína e dois resíduos de histidina (Cys 2 His 2 ). No entanto, existem ZFs que podem coordenar mais de um átomo de zinco e outros onde a ordem dos resíduos Cys e His varia.

O ZF pode ser encontrado repetido em um lote, configurado linearmente na mesma proteína. Todos têm estruturas semelhantes, mas podem ser quimicamente diferenciados entre si por variações dos principais resíduos de aminoácidos para o cumprimento de suas funções.

Uma característica comum entre os ZFs é a capacidade de reconhecer moléculas de DNA ou RNA de diferentes comprimentos, razão pela qual elas foram inicialmente consideradas apenas como fatores transcricionais.

Tipicamente, o reconhecimento é de regiões de 3 pb no DNA e é alcançado quando a proteína do domínio ZF apresenta a hélice alfa no sulco principal da molécula de DNA.

Relacionado:  Jara (Cistus): características, habitat, espécies, propriedades, pragas

Classificação

Existem diferentes motivos ZF que diferem uns dos outros por sua natureza e pelas diferentes configurações espaciais que alcançam vínculos de coordenação com o átomo de zinco. Uma das classificações é a seguinte:

C 2 H 2

Esse é um motivo comumente encontrado na ZF. A maioria dos motivos C 2 H 2 são específicas para a interacção com o ADN e ARN, no entanto, não têm sido envolvidos em interacções proteína-proteína. Eles têm entre 25 e 30 resíduos de aminoácidos e são encontrados na maior família de proteínas reguladoras das células de mamíferos.

Dedos de zinco: estrutura, classificação, função e importância 2

Estrutura primária de um domínio de dedo de zinco C2H2, incluindo os links que coordenam o íon de zinco e com um fundo de “mão e dedo” (AngelHerraez [CC BY-SA 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by-sa /4.0)], via Wikimedia Commons)

C 2 H

Eles interagem com o RNA e algumas outras proteínas. Eles são observados principalmente como parte de algumas proteínas do capsídeo do retrovírus, colaborando no empacotamento do RNA viral logo após a replicação.

C 4 (laço ou fita)

As proteínas com esse motivo são enzimas responsáveis ​​pela replicação e transcrição do DNA. Um bom exemplo disso pode ser as enzimas brutas dos fagos T4 e T7.

C 4 (família GATA)

Esta família de ZF compreende fatores de transcrição que regulam a expressão de genes importantes em numerosos tecidos durante o desenvolvimento celular. Os fatores GATA-2 e 3, por exemplo, estão envolvidos na hematopoiese.

C 6

Esses domínios são típicos de leveduras, especificamente a proteína GAL4, que ativa a transcrição de genes envolvidos no uso de galactose e melibiosa.

Dedos de zinco (C 3 HC 4 -C 3 H 2 C 3 )

Estas estruturas particulares possuem dois subtipos domínios ZF (C 3 HC 4 e C 3 H 2 C 3 ) e estão presentes em muitas proteínas animais e vegetais.

Eles são encontrados em proteínas como a RAD5, envolvidas no reparo do DNA em organismos eucarióticos. Eles também são encontrados no RAG1, indispensável para a reconfiguração das imunoglobulinas.

H 2 C 2

Este domínio ZF é altamente conservado nas integrase de retrovírus e retrotransposons; juntar a proteína branca causa uma mudança conformacional nela.

Funções

As proteínas com domínios ZF servem a vários propósitos: podem ser encontradas em proteínas ribossômicas ou em adaptadores transcricionais. Eles também foram detectados como parte integrante da estrutura da RNA polimerase II da levedura.

Eles parecem estar envolvidos na homeostase intracelular do zinco e na regulação da apoptose ou morte celular programada. Além disso, existem algumas proteínas com ZF que funcionam como acompanhantes para dobrar ou transportar outras proteínas.

A ligação lipídica e um papel fundamental nas interações proteína-proteína também são funções proeminentes dos domínios ZF em algumas proteínas.

Importância biotecnológica

Ao longo dos anos, o entendimento estrutural e funcional dos domínios da ZF nos permitiu grandes avanços científicos que envolvem o uso de suas características para fins biotecnológicos.

Como algumas proteínas com ZF têm grande especificidade para certos domínios do DNA, atualmente são investidos muito esforços no design de ZFs específicas, o que pode contribuir com avanços valiosos na terapia gênica em humanos.

Relacionado:  Cape Lion: características, habitat, dieta, morfologia

Aplicações biotecnológicas interessantes também surgem do projeto de proteínas com ZF modificado por engenharia genética. Dependendo da finalidade desejada, alguns destes podem ser modificados pela adição de peptídeos com dedos de “zinco-zinco”, capazes de reconhecer virtualmente qualquer sequência de DNA com alta afinidade e especificidade.

A edição genômica com nucleases modificadas é uma das aplicações mais promissoras atualmente. Este tipo de edição oferece a possibilidade de realizar estudos sobre a função genética diretamente no sistema modelo de interesse.

A engenharia genética usando nucleases de ZF modificadas chamou a atenção de cientistas no campo do aprimoramento genético de cultivares de importância agronômica. Essas nucleases foram usadas para corrigir um gene endógeno que produz formas resistentes a herbicidas em plantas de tabaco.

Nucleases com ZF também foram empregadas para a adição de genes em células de mamíferos. As proteínas em questão foram usadas para gerar um conjunto de células isogênicas de camundongo com uma série de alelos definidos para um gene endógeno.

Tal processo tem uma aplicação direta na rotulagem e criação de novas formas alélicas para estudar as relações de estrutura e função em condições nativas de expressão e em ambientes isogênicos.

Referências

  1. Berg, JM (1990). Domínios do dedo de zinco: hipóteses e conhecimento atual. Revisão Anual de Biofísica e Química Biofísica , 19 (39), 405-421.
  2. Dreier, B., Beerli, R., Segal, D., Flippin, J., & Barbas, C. (2001). Desenvolvimento de domínios de dedos de zinco para reconhecimento da família 5′-ANN-3 ‘de seqüências de DNA e seu uso na construção de fatores de transcrição artificiais. JBC (54).
  3. Gamsjaeger, R., Liew, CK, Loughlin, FE, Crossley, M., & Mackay, JP (2007). Dedos pegajosos: dedos de zinco como motivos de reconhecimento de proteínas. Trends in Bioochemical Sciences , 32 (2), 63–70.
  4. Klug, A. (2010). A descoberta dos dedos de zinco e suas aplicações na regulação e manipulação de genomas. Revista Anual de Bioquímica , 79 (1), 213-231.
  5. Kluska, K., Adamczyk, J., & Krȩzel, A. (2017). Propriedades de ligação de metal dos dedos de zinco com um local de ligação de metal naturalmente alterado. Metalomics , 10 (2), 248-263.
  6. Leigos, JH, Lee, BM, & Wright, PE (2001). Proteínas dos dedos de zinco: novas idéias sobre a diversidade estrutural e funcional. Opinião Atual em Biologia Estrutural , 11 (1), 39–46.
  7. Miller, J., McLachlan, AD, & Klug, A. (1985). Domínios repetitivos de ligação ao zinco no fator de transcrição de proteínas IIIA de oócitos de Xenopus. Journal of Trace Elements in Experimental Medicine , 4 (6), 1609-1614.
  8. Urnov, FD, Vergalhões, EJ, Holmes, MC, Zhang, HS e Gregory, PD (2010). Edição de genoma com nucleases de dedo de zinco projetadas. Nature Reviews Genetics , 11 (9), 636-646.

Deixe um comentário